Kwestia zabezpieczeń przeciwpowodziowych jest bardzo istotna. Dwa zbiorniki retencyjne w rejonie Wzgórz Krzesławickich są praktycznie gotowe i będą służyć do gromadzenia wód opadowych, o co społeczność zabiegała od wielu lat. Miasto ubiega się o fundusze i tereny pod kolejne zabezpieczenia w Nowej Hucie. Natomiast w Bieżanowie trwa budowa ostatniego suchego zbiornika Malinówka 3, który po ukończeniu powinien zmniejszyć ryzyko powodzi na rzece Serafa.
Od dwunastu lat mieszkańcy ul. Folwarcznej i Burzowej dążą do ochrony przed powodzią. Pierwszy z dwóch małych zbiorników retencyjnych jest już gotowy, a drugi jest w fazie końcowej. Teraz planowane jest uruchomienie budowy kanalizacji deszczowej.
Dzięki zbiornikom przy ul. Folwarcznej i przy ul. Burzowej zostanie zwiększona powierzchnia retencyjna o ponad 4 tys. m3, a teren ochronny obejmie ponad 500 ha. Aby skutecznie chronić Nową Hutę, podobne zabezpieczenia powinny zostać zrealizowane m.in. w Łuczanowicach, Grębałowie oraz przy ul. Marglowej.
Ten etap zakończył się w Bieżanowie koło Krakowa, gdzie po serii problemów związanych między innymi z pozyskiwaniem gruntów trwa budowa ostatniego planowanego zbiornika Malinówka 3. Suchy zbiornik, mający zapewnić bezpieczeństwo przeciwpowodziowe w rejonie rzeki Serafy, ma być gotowy na początku przyszłego roku. Pozostaje jeszcze kwestia bezpieczeństwa gmin nad rzeką Prądnik.